
Master BIP M2 “Globule Rouge et Biologie Transfusionnelle” GRBioT
Présentation générale du M2 BIP parcours GRBioT
Le parcours de Master Globule Rouge et Biologie Transfusionnelle, GRBioT, est une formation à et par la recherche. Il vise à élargir les connaissances universitaires actuelles en hématologie en y intégrant pleinement la physiologie et les pathologies du globule rouge et des cellules sanguines, les dysfonctionnements de l’érythropoïèse et du métabolisme du fer, à l’origine de très nombreuses pathologies, ainsi que les liens globules rouges et parasites.
Les globules rouges circulent dans l’ensemble des tissus de l’organisme et sont impliqués dans nombre de pathologies hématologiques et non hématologiques comme le diabète ou l’artériosclérose et leur rôle dans les pathologies vasculaires et inflammatoires est largement reconnu.
La biologie et la médecine transfusionnelle sont des disciplines à part entière de l’hématologie et l’acte transfusionnel est sans doute un des plus prescrits à ce jour. Au-delà de la médecine, l’étude des groupes sanguins apporte des connaissances immenses sur la fonction des protéines membranaires qui les expriment et qui sont très souvent exprimées dans les autres tissus. Les rares phénotypes « nuls » (absence totale d’un groupe sanguin à la surface des globules rouges) représentent des outils de « knock out » naturels puissants afin d’étudier les pathologies humaines.
Enfin, la fabrication de globules rouges in vitro, à l’échelle industrielle à partir de cellules souches est un enjeu mondial important tant pour des visées transfusionnelles que pour de potentiels véhicules de médicaments
La formation propose une étude approfondie de :
- la différentiation érythroïde, depuis les cellules progénitrices jusqu’au globule rouge mature, ainsi que les différentes pathologies impliquant la fonction érythroïde (anémies, maladies infectieuses, génétiques, métaboliques, etc.)
- les bases moléculaires des groupes sanguins et plaquettaires, et les enjeux et risques associés à la transfusion sanguine.
Cette formation est une des seules seule à avoir intégré une formation organisée par le secteur lettres et sciences humaines de l’Université liée à des enjeux éthiques, sociétales et de santé publique.
Le parcours GRBioT, adossé au InidEx-Labex GREx , propose une approche transdisciplinaire à l’interface entre recherche fondamentale et recherche translationnelle/clinique, ouvrant ainsi non seulement sur un parcours de thèse de science, mais également sur de nombreuses possibilités d’insertion professionnelle.
Objectifs
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Formation à et par la recherche : Acquérir, interpréter et appliquer les connaissances en biochimie, biologie moléculaire et cellulaire, physiologie, éthique, afin de comprendre les processus physiologiques et pathologiques impliqués dans l’érythropoïèse, les pathologies du globule rouge, les relations hôte-pathogènes, les biothérapies innovantes et la biologie transfusionnelle
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Comprendre les bases moléculaires et physiologiques des maladies du globule rouge et de l’érythropoïèse chez l’homme, mais également les pathologies où les globules rouges sont des acteurs majeurs, notamment des pathologies vasculaires et inflammatoires
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Comprendre les enjeux et les risques de la biologie transfusionnelle à travers l’immunohématologie des groupes sanguins et plaquettaires et l’émergence des nouveaux agents infectieux
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Connaitre, appliquer et développer des approches expérimentales dans les champs du master
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Contribuer au développement et à la réalisation d’un projet de recherche, notamment en équipe
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Communiquer et diffuser à l’oral et à l’écrit en français et en anglais
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Connaître les enjeux de la recherche translationnelle
Compétences visées
Compétences disciplinaires
- Contribuer à la conception et à la mise en œuvre de projets de recherche fondamentaux, translationnels ou appliqués
- Concevoir, planifier et réaliser des protocoles expérimentaux
- Comprendre et utiliser les technologies utilisées et les plates formes dédies aux projets
Compétences pré-professionnelles
- Comprendre et appliquer une démarche scientifique et expérimentale rigoureuse
- Obtenir et analyser des données scientifiques avec les outils numériques de référence
- Concevoir et mettre en œuvre un projet de recherche et également de recherche et développement
- Gérer et maîtriser les outils et ressources informatiques scientifiques
- Aptitude à la diffusion écrite et orale d’informations et résultats scientifiques
Compétences personnelles
- Aptitude au travail en autonomie et en équipe
- Maîtrise de la littérature et l’anglais scientifiques
- Aptitude à produire des documents écrits complexes (projets, rapports)
- Aptitude à s’exprimer et à débattre
- Acquérir les savoir-faire dans l’étude du globule rouge, des cellules sanguines, de l’érythropoïèse et de la transfusion sanguine
- Acquérir les aptitudes à problématiser et à conduire une démarche expérimentale et scientifique rigoureuse
- Acquérir les aptitudes à travailler avec des équipes de recherche fondamentale et clinique.
- Comprendre et synthétiser des données scientifiques diffusées en anglais
- Aptitudes à la recherche de stage et au travail en milieu professionnel
Programme
Master 2 : 60 ECTS dont 30 de stage de recherche en laboratoire ou entreprise (2nd semestre)
Semestre 3 : Les étudiants doivent valider 30 ECTS. Les UEs 1 à 5 sont obligatoires et totalisent 18 ECTS, les 12 ECTS restants sont à compléter par le choix des UEs 6 à 8 ou à choisir dans les autres parcours du Master BIP ou dans un autre Master, en accord avec les responsables du parcours selon le projet professionnel envisagé. Il comporte également la validation de la maîtrise de l’anglais, un travail bibliographique, et la présentation orale du projet de recherche. Les cours démarrent fin octobre
- UE 1 : Pathologies du globule rouge et thérapies innovantes (6 ECTS) Site Necker
- UE 2 : Le sang sous le regard des sciences humaines et sociales (3 ECTS) Site Grands Moulins
- UE 3 : Érythropoïèse et pathologies de l’érythropoïèse (3 ECTS) Site Imagine
- UE 4 : Physiologie et physiopathologie du métabolisme du fer (3 ECTS) Site Necker
- UE 5 : Présentation projet de Recherche en anglais (3 ECTS) Site Necker
- UE 6 : Immunohématologie : groupes sanguin érythrocytaires et plaquettaires (6 ECTS) Site Necker
- UE 7 : Globule rouges et infections (3 ECTS) Site Necker
- UE 8 : Le Globule Rouge et son environnement cellulaire et tissulaire (3 ECTS) Site Necker
Semestre 4 : Stage de 6 mois en laboratoire de recherche, mémoire écrit et soutenance orale
Contrôle des connaissances :
- Contrôles continus et examens terminaux (oraux/écrits)
- Stages sur mémoire écrit et soutenance orale
- Aménagements particuliers pour étudiants en situation de handicap ou sportifs de haut niveau
Aménagements particuliers
Aménagements particuliers pour étudiants en situation de handicap ou sportifs de haut niveau
Étudiants en situation de handicap :
- Relais handicap Campus des Grands Moulins
Pour les étudiants du campus des Grands Moulins, Bichat, Villemin, Pajol, Cuvier, Garancière
Bât. Halle aux Farines Hall E, RDC gauche – allée paire
Rue Françoise Dolto Paris 13e
01 57 27 65 20
relais-grandsmoulins@u-paris.fr
- Relais handicap Odéon
Pour les étudiants des autres sites
Bureau A.1.8 et A.1.9
12 rue de l’Ecole de Médecine Paris 6e
01 76 53 17 64
01 76 53 17 01
relais-odeon@u-paris.fr
(Privilégier les mails)
Admission
Public cible
Titulaires de : M1 (parcours recherche ou parcours Santé équivalent M1) ou médecin/pharmacien/vétérinaire/biologiste ou ingénieur
Conditions d’admission
M2 : Très bon niveau en biologie cellulaire, biologie moléculaire et physiologie.
Bonne maitrise de l’anglais scientifique. Validation d’au moins une UE de stage de recherche est un bonus
Pré-requis
M2 : Expérience de stage(s) en laboratoire est fortement recommandée. Un bon niveau en anglais lu et écrit est demandé.
Modalités de candidature
Diplôme et compétences requis: M1 PAPH-BIO ou M1 santé ou équivalent ou médecin/pharmacien (parcours recherche) ou ingénieur. Connaissance approfondie en biologie cellulaire, moléculaire et physiologie
Dépôt de candidatures sur la plateforme eCandidat
1ère campagne de candidature du 14 avril au 27 juin.
https://ecandidat.app.u-paris.fr/sciences1/#!accueilView
Une seconde campagne aura lieu du 18 août au 26 septembre.
https://ecandidat.app.u-paris.fr/sciences2/connect#!accueilView
Pour plus d’information sur le parcours GRBioT, contactez et/ou
Secrétariat Pédagogique : Mme Anicette Anon
Le dossier de candidature pour le parcours GRBioT du master BIP doit inclure les documents listés ci-dessous en format pdf
- Photocopie de votre passeport ou de votre CNI si vous êtes de nationalité française ou d’un autre pays de l’Union Européenne
- Un CV (2 pages maximum)
- Une lettre de motivation expliquant votre projet professionnel (2 pages maximum)
- Votre dossier académique incluant les photocopies de tous vos relevés de notes ET de vos diplômes de vos années d’études supérieures dans leur langue originale ET la traduction certifiée en français (les documents en français, anglais ou espagnol ne nécessitent pas la traduction)
- Une lettre de recommandation d’un ou deux référents académiques (un référent académique est un professeur de votre université d’origine ou le responsable de l’équipe ou vous avez fait un stage dans des domaines scientifiques ou technologiques).
- Tout autre document que vous souhaitez ajouter
Si vous avez besoin de conseil sur l’adéquation de votre profil à cette formation, vous pouvez envoyer votre dossier en format pdf (document unique) à et
Et après ?
Poursuite d’études
Formation visée : doctorat
Passerelle
Des passerelles vers les études de santé sont ouvertes sur dossier pour les étudiants ayant validé leur master
Débouchés professionnels
Métiers
Chargé de projet, Attaché de recherche clinique, Ingénieur d’étude, Chercheurs*, Enseignant-chercheur*, Carrière hospitalo-universitaire*, responsable projet dans les start-ups et sociétés industrielles, biologistes et cadres dans l’univers de la transfusion.
*après un doctorat
Domaine et/ou secteur d’activité
- Laboratoire publics ou privés de recherche et développement
- Hôpital
- Secteur pharmaceutique, biotechnologies
- Start-UPs dans le domaine du développement des produits sanguins
- Etablissement Français du Sang
Laboratoires d'Accueil (liste non exhaustive)
-
Responsable(s) de l’Equipe
Affiliation
Courriels et site web
Thématique de recherche
Slim Azouzi et Bérengère Koehl
INSERM UMR-S1134
Biologie intégrée du globule rouge et de l’Erythropoïèse,
Equipe BAHSic
Recherche multidisciplinaire et translationnelle sur les groupes sanguins, la drépanocytose et d’autres pathologies du globule rouge (GR)
Pierre Buffet et Pascal Amireault
INSERM UMR-S1134
Biologie intégrée du globule rouge et de l’Erythropoïèse,
Equipe BioTiGR
Biologie Tissulaire du GR, physiologie splénique, anémies rares ; paludisme
Alexandre de Brevern
INSERM UMR-S1134
Biologie Intégrée du Globule Rouge et de l’Erythropoïèse,
Equipe DSIMB
Etude in silico des complexes membranaires du GR
Laurent Gouya et Sophie Lefevre
INSERM UMR-S1134
Biologie intégrée du globule rouge et de l’Erythropoïèse,
Equipe PAMS
Métabolisme normal et pathologique de l’hème et du fer, porphyries érythropoïetiques et hépatiques
Maturation terminale érythroïde. Clearance d’Organelles
Maladie de Gaucher
Olivier Hermine
INSERM U1163/CNRS ERL 8254 Laboratoire Mécanismes cellulaires et moléculaires des désordres hématologiques et implications thérapeutiques
Erythropoïèse normale et pathologique, thalassémies et drépanocytose
Michaela Fontenay
INSERM U1016/UMR8104 Hématopoïèse normale et pathologique
Hématopoïèse normale et pathologique. Syndromes myélodysplasiques
Carole Peyssonnaux
INSERM U1016
Hypoxie et homéostasie du fer
Hypoxie et homéostasie du fer
Pierre-Louis Tharaux
INSERM 970
Gpcrs and tyrosine kinase receptors : roles and interactions in development and disease
Kidney disease-Vascular disese-Sickle cell disease
Brigitte Ranque
UMR1153 CRESS, Centre de Recherche en Epidémiologie et Statistiques
METHODS – CRESS – Centre de Recherche en Epidémiologie et Statistiques
Epidémiologie de la drépanocytose
Isabelle Plo
INSERM UMR 1170 Hématopoïèse normale et pathologique
Mégacaryopoièse normale et pathologiques
Naomi Taylor et Sandrina Kinet
Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier
CNRS-UMR 5535 Hematopoïèse et Immunothérapie
https://www.igmm.cnrs.fr/team/hematopoiese-et-immunotherapie/
https://www.igmm.cnrs.fr/team/hematopoiese-et-immunotherapie/
Métabolisme et hématopoïèse/érythropoïèse
Philippe Connes
Laboratoire Interuniversitaire de Biologie de la Motricité (LIBM)
https://libm.univ-st-etienne.fr/fr/index.html
Biologie Vasculaire du Globule Rouge.
Drépanocytose
France Pirenne
Institut Mondor de Recherche Biomédicale, INSERM U955, Créteil.
Equipe Pirenne
Transfusion et maladies du globule rouge
Catherine Lavazec
INSERM U1016 Biologie de la transmission de plasmodium
Equipe Lavazec
Erythropoièse et paludisme
Loic Garçon
HEMATIM – UR UPJV 4666
CURS UPJV, site CHU, Amiens
https://www.u-picardie.fr/unites-de-recherche/hematim/
Recherche sur les mécanismes impliqués dans l’hématopoïèse normale et pathologique. Membranopathies
Annarita Miccio
INSERM U1163/CNRS ERL 8254 Laboratoire Chromatine et régulation des gènes au cours du développement
https://www.institutimagine.org/fr/annarita-miccio-189
Dynamique des réseaux transcriptionnels et épigénétiques au cours du développement des cellules souches
Approches moléculaires pour le traitement des β-hémoglobinopathies
Eric Soler
Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier
CNRS-UMR 5535
https://www.igmm.cnrs.fr/team/hematopoiese-moleculaire/
3D genome organization provides a framework for efficient control of gene expression in time and space
Emmanuel Payen
UMR1184 « Immunologie des Maladies Virales Autoimmunes, Hématologique, Bactérienne », INSERM/CEA/U. P. SACLAY
CEA de Fontenay aux Roses
Cellules Souches et Application Thérapeutiques
Stéphane Egée
CNRS UMR 8227
Compared Physiology of Erythrocytes
Physiologie du globule rouge-canaux et transporteurs
Jacques Chiaroni et Wassim El Nemer
CNRS UMR 7268 ADES
Equipe Génétique évolutive, Globule rouge, Biothérapie (GENGLOBE)
Biologie du globule rouge et maladies génétiques
Polymorphisme immunogène et implications en biothérapieEmmanuelle Génin et Gérald Le Gac
UMR1078- Génétique, Génomique fonctionnelle et Biotechnologies
Equipe Biomedicine and Integrative Genetics & Genomics
Génétique Moléculaire et Fonctionnelle Hémochromatose et Maladies Héréditaires du Métabolisme du Fer
Zoran Ivanovic
U 1211-MRGM Maladies rares génétiques et métabolisme
Cellules souches hématopoïétiques
Anaïs Merckx
Unité MERIT IRD-UPC
Paludisme et Globules rouges
Yaël Zermati et Laurance Guyonneau
EFS-Hôpital St Antoine
Hématopoïèse et érythopoïèse
Génération in vitro de globules rouges
Lydie Da Costa
Service d’Hématologie Biologique, Hôpital Bicêtre/Paul Brousse.
Anémie de Blakfan Diamond
Olivier Blanc-Brude
Laboratory Complex Matter and Systems ‘MSC-Med’
IVETh Integrator,
Production, Ingénierie et Caractérisation des vésicules extracellulaires pour la médecine personnalisée
Offres de Stage (liste non exhaustive)
1)
Proposition de Stage de Master (M2)
Master GRBioT
Université de Paris – UFR des Sciences du Vivant
Equipe d’Accueil : Mécanismes cellulaires et moléculaires des désordres hématologiques
Intitulé de l’Unité : Institut Imagine
Nom du Responsable de l’Unité : Bana Jabri
Nom du Responsable de l’Équipe : Olivier Hermine
Adresse : 24 boulevard du Montparnasse
Responsable de l’encadrement : Pascal Amireault
E-mail:
Titre du sujet de recherche (Français et anglais) :
Impact de l’inhibition du protéasome sur le vieillissement du globule rouge dans un modèle murin
Impact of proteasome inhibition on red blood cell aging in a mouse model
Résumé du projet
État de l’art : Les globules rouges (GR) sont responsables du transport d’oxygène dans le sang et ont une durée de vie de 120 jours chez l’humain (50 jours chez la souris). Le GR n’est pas touché par les altérations courantes liées au vieillissement des cellules nucléées car il est dépourvu de noyau et de mitochondries. La dysfonction de la protéostase apparaît comme le principal processus de vieillissement partagé par le GR avec les cellules nucléées. Les principaux acteurs de la protéostase sont les chaperonnes, qui assurent le maintien d’une bonne conformation protéique, et le protéasome, qui dégrade les protéines oxydées/mal repliées, empêchant la formation d’agrégats toxiques. Nos résultats préliminaires de protéomique, de mesures d’activité du protéasome et de l’impact de son inhibition montrent un rôle crucial de la protéostase ainsi qu’une altération de sa fonction dans les vieux GR.
Objectif : L’objectif général de ce projet est de caractériser, dans un modèle murin, le vieillissement accéléré du GR dont le protéasome est inhibé à la recherche d’un ou plusieurs marqueur(s) caractéristique(s) du GR sénescent.
Méthodologie : Des GR murins seront traités in vitro avec un inhibiteur irréversible du protéasome, marqués et retransfusés à une souris receveuse. Les souris receveuses seront prélevées après la transfusion pour des expériences sur les marqueurs du vieillissement cellulaire, y compris la taille et la morphologie (cytométrie d’image), et l’exposition de la phosphatidylsérine (cytométrie de flux). Des marqueurs de la protéostase, y compris l’ubiquitination des protéines, l’agrégation des protéines et la détection de corps cellulaire seront également analysés (cytométrie d’image). À deux moments choisis, des GR seront triés par cytométrie pour déterminer leur filtrabilité, leur niveau d’ATP et d’activité du protéasome.
Conclusion et perspectives : Cette exploration permettra une compréhension approfondie du dysfonctionnement moléculaire qui conduit à la sénescence des GR en physiologie.
Dernières Publications en lien avec le projet :
- Peltier S, Marin M, Dzieciatkowska M, Dussiot M, Roy MK, Bruce J, Leblanc L, Hadjou Y, Georgeault S, Fricot A, Roussel C, Stephenson D, Casimir M, Sissoko A, Paye F, Dokmak S, Ndour PA, Roingeard P, Gautier EF, Spitalnik SL, Hermine O, Buffet PA, D’Alessandro A, Amireault P. Proteostasis and metabolic dysfunction characterize a subset of storage-induced senescent erythrocytes targeted for post-transfusion clearance. J Clin Invest (2025) Mar 11:e183099.
2)
Proposition de Stage de Master (M2)
Master GRBioT
Université de Paris – UFR des Sciences du Vivant
Equipe d’Accueil :
Intitulé de l’Unité : Paris cardiovascular Research Centre – PARCC, Inserm UMR970
Nom du Responsable de l’Unité : Jean-Sébastien Silvestre
Nom du Responsable de l’Équipe : Pierre-Louis Tharaux et Olivia Lenoir
Adresse : 56 rue Leblanc, 75015, Paris, France
Responsable de l’encadrement : Pierre-Louis Tharaux
https://parcc.inserm.fr/index.php/08-objectives/
Titre du sujet de recherche (Français et anglais) :
- Evaluation of the Role of Mast Cells and Basophils in Sickle Cell Disease Complications.
- Evaluation du rôle des mastocytes et granulocytes basophiles dans les complications de la drépanocytose.
Résumé du projet en (quelques lignes)
Sickle cell disease (SCD) is a severe hemoglobin disorder affecting millions of people worldwide. The classic view of pathophysiology involves the polymerization of mutated hemoglobin S (HbS), leading to red blood cell (RBC) sickling with subsequent hemolytic anemia, ischemic-reperfusion-induced tissue lesions, painful vaso-occlusive crisis
(VOC), stroke, and acute chest syndrome (ACS). Current treatment options such as hydroxyurea, chronic transfusion, anti-P-selectin antibodies, or voxelotor do not fully prevent life-threatening acute and chronic complications of SCD. Allogeneic stem cell transplantation and gene therapy are available only for a minority of patients, are associated with toxicity, and are very expensive.
Recently, a major role of inflammation mediated by innate immune cells and promoting vaso-occlusion has been evidenced. Our clinical observations and experimental work in mice demonstrated that the mutated hemoglobin, HbS, activates mast cells and basophils and might be key players orchestrating acute and chronic SCD complications. Here, we will develop new predictive and theranostic tools and a novel therapeutic solution targeting mast cells and basophils with masitinib. This tyrosine kinase inhibitor has proven its safety and efficacy in mast cell disorders.
The Master student will investigate the various subsets of innate immune cells in the kidney, lungs, liver and the heart of SCD mice during experimental VOC and during aging. He/she will determine the best use of masitinib in SCD mouse models. We will rely on a solid network of academic laboratories to investigate in preclinical models (transgenic SCD mice) the role and best use of masitinib to target mast cell/basophils in acute (VOC/ACS) and chronic complications of SCD (including kidney, cardiac, lung, liver, and retina complications, pain and addiction to opioids, cognitive dysfunction), to determine the best clinical and biological criteria of inclusion and evaluation of patients with SCD treated with masitinib.
Dernières Publications en lien avec le projet :
Deletion of the myeloid endothelin-B receptor confers long-term protection from angiotensin II-mediated kidney, eye and vessel injury.
Guyonnet L, Czopek A, Farrah TE, Baudrie V, Bonnin P, Chipont A, Lenoir O, Sennlaub F, Roubeix C, Webb DJ, Kluth DC, Bailey MA, Tharaux PL*, Dhaun N*. (*co-last and corresponding authors)
Kidney Int. 2020;98(5):1193-1209.
Following the demonstration that monocytes and macrophages can modulate vascular reactivity by controlling the local concentration of endothelin-1 (ET-1)(Eur Heart J 2019), demonstration of the involvement of the myeloid ETB receptor in the genesis of hypertensive microvascular lesions.
The endothelin B receptor plays a crucial role in the adhesion of neutrophils to the endothelium in sickle cell disease.
Koehl B*, Nivoit P*, El Nemer W*, Lenoir O*, Hermand P, Pereira C, Brousse V, Guyonnet L, Ghinatti G, Benkerrou M, Colin Y, Le Van Kim C, Tharaux PL. (* co-first authors).
Haematologica. 2017;102(7):1161-1172.
We showed that human neutrophils have functional ETB receptors with calcium signaling capability, leading to increased adhesion to the endothelium through effects on both endothelial cells and neutrophils.
3)
Proposition de Stage de Master (M2)
Master GRBioT
Université de Paris – UFR des Sciences du Vivant
Equipe d’Accueil : Dynamique Chrtomatinienne et Hématopoïèse
Intitulé de l’Unité : Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM)
Nom du Responsable de l’Unité : E. Schwob
Nom du Responsable de l’Équipe : Eric Soler
Adresse : 1919 route de mende, Montpellier
Responsable de l’encadrement : Dr. Eric Soler / Dr. Charlotte Andrieu-Soler
E-mail:
Titre du sujet de recherche (Français et anglais) :
Etude fonctionnelle d’une nouvelle ubiquitine ligase impliquée dans la différenciation terminale érythroïde
Functional analysis of a novel putative ubiquitin ligase in the regulation of terminal erythroid differentiation
Résumé du projet (en Français) :
L’érythropoïèse terminale repose sur une balance délicate entre prolifération et différenciation des progéniteurs érythroïdes. Cette balance est contrôlée par l’expression dynamique de gènes prolifératifs comme les oncogènes MYB, KIT, MYC qui stimulent la prolifération des progéniteurs immatures et inhibent leur entrée en différenciation. Lors de l’entrée en différenciation terminale, leur expression est rapidement et fortement inhibée, permettant aux précurseurs érythroïdes d’enclencher leur programme de différenciation. Les mécanismes contrôlant cette dynamique d’expression génique restent mal compris, malgré leur importance fondamentale en hématologie et onco-hématologie. Nous avons récemment réalisé un crible génétique pour identifier les mécanismes moléculaires impliquées et avons identifié une nouvelle ubiquitine ligase de fonction inconnue comme acteur majeur de ce processus. Le projet vise à caractériser le rôle de cette enzyme en identifiant ses cibles cellulaires (protéome de proximité) et l’impact de son inactivation génétique (CRISPR) sur le transcriptome (RNA-Seq) et l’épigénome (ATAC-Seq) érythroïde.
Abstract (English) :
Terminal erythroid differentiation relies on a delicate balance between proliferation and differentiation of erythroid progenitors. This balance is controlled by the dynamic expression of proliferative genes such as the MYB, KIT and MYC oncogenes, which stimulate the proliferation of immature progenitors and inhibit their entry into differentiation. Upon entry into terminal differentiation, expression of such genes is dramatically inhibited, allowing erythroid precursors to initiate their differentiation program. The mechanisms controlling this gene expression dynamics remain poorly understood, despite their fundamental importance in hematology and onco-hematology. We recently performed a genetic screen to identify the molecular mechanisms involved, and identified a novel ubiquitin ligase of unknown function as a major player in this process. The project aims to characterize the role of this enzyme by identifying its cellular targets (proximity proteome) and the impact of its genetic inactivation (CRISPR) on the erythroid transcriptome (RNA-Seq) and epigenome (ATAC-Seq).
Dernières Publications en lien avec le projet :
Deleuze V, Stephen T, Salma M, Orfeo C, Jorna R, Maas A, Barroca V, Arcangeli ML, Lecellier CH, Andrieu-Soler C, Grosveld F, Soler E.
Sci Rep. 2025 Mar 15;15(1):8996. doi: 10.1038/s41598-025-94222-8.
Fagnan A, Aid Z, Baille M, Drakul A, Robert E, Lopez CK, Thirant C, Lecluse Y, Rivière J, Ignacimouttou C, Salmoiraghi S, Anguita E, Naimo A, Marzac C, Pflumio F, Malinge S, Wichmann C, Huang Y, Lobry C, Chaumeil J, Soler E, Bourquin JP, Nerlov C, Bernard OA, Schwaller J, Mercher T.
Hemasphere. 2024 Jun 19;8(6):e90. doi: 10.1002/hem3.90. eCollection 2024 Jun.
Deleuze V, Soler E, Andrieu-Soler C.
STAR Protoc. 2024 Jun 21;5(2):103016. doi: 10.1016/j.xpro.2024.103016. Epub 2024 Apr 17.
Efficient genome editing in erythroid cells unveils novel MYB target genes and regulatory functions.
Deleuze V, Garcia L, Rouaisnel B, Salma M, Kinoo A, Andrieu-Soler C, Soler E.
iScience. 2023 Aug 15;26(9):107641. doi: 10.1016/j.isci.2023.107641.
Salma M, Andrieu-Soler C, Deleuze V, Soler E.
Blood Cells Mol Dis. 2023 Jul;101:102745. doi: 10.1016/j.bcmd.2023.102745.
Erythroid Cell Research: 3D Chromatin, Transcription Factors and Beyond.
Andrieu-Soler C, Soler E.
Int J Mol Sci. 2022 May 30;23(11):6149. doi: 10.3390/ijms23116149.